1991年，执导由刘德凯、张晨光、方芳等联袂主演的传奇剧《京城四少》；同年，执导古装剧《碧海情天》。

1992年，执导由谢祖武、蓝心湄、李亚明联合主演的古装剧《英雄少年》。

1993年，执导由马景涛、叶童、周海媚联袂主演的古装武侠剧《倚天屠龙记》。

1995年，执导年代剧《今生今世》；同年，执导武侠剧《新龙门客栈》，凭借该剧获得第32届台湾金钟奖最佳导演奖。

1996年，执导爱情电视剧《侬本多情》，该剧由刘嘉玲、马景涛、吴启华主演。

1997年，执导由任贤齐、吴倩莲合作主演的武侠剧《神雕侠侣》。

1998年，执导古装剧《天地奇英花木兰》；同年，执导由陈道明、孙翠凤、翁虹联合主演的古装剧《新女巡按》。

1999年，执导由任贤齐、袁咏仪、陈德容联袂主演的古装武侠剧《笑傲江湖》。

2000年，执导由王亚楠、曾黎共同主演的古装爱情剧《东西奇遇结良缘》。

2001年，执导神话剧《青蛇与白蛇》；同年，执导由林志颖、TAE、郑国霖等联袂出演的古装武侠剧《绝世双骄》。

2002年，执导由苏有朋、贾静雯、高圆圆、张国立、张铁林领衔主演的武侠剧《倚天屠龙记》。

2003年，执导由贾静雯、赵文卓、刘雪华、张铁林联袂主演的古装奇幻爱情剧《神医侠侣》。

2005年，执导的古装剧《秦王李世民》播出；同年，执导魔幻剧《雪域迷城》；同年，执导由苏有朋、张娜拉等联袂主演的古装爱情轻喜剧《刁蛮公主》。

2006年，执导由殷桃、邓超、黄维德联合主演的都市情感剧《新昨夜星辰》；同年，执导由吕丽萍、孙海英、叶青青、赵亮等领衔主演的古装剧《皇后驾到》。

2007年，执导由叶童、倪齐民搭档主演的都市爱情剧《富贵在天》；同年，执导由杜淳、高圆圆、刘德凯联袂主演的民国爱情剧《爱无悔》；同年，担任艺术指导的民国剧《绣娘兰馨》在东方电影频道首播。

2008年，执导由潘仪君、邱心志合作主演的爱情剧《船娘文慧》。

2009年，执导由秦岚、林文龙、郑佩佩领衔主演的年代悬疑剧《深宅》；5月14日，执导的年代剧《新情义无价》在安徽卫视播出。

2010年，担任年代爱情剧《再见艳阳天》的导演，该剧讲述了几个性格迥异的年轻人在面对命运、感情、理想时的矛盾和挣扎；同年，执导台湾电视剧《源》。该剧由张善为、徐丽雯、温升豪等主演。

2011年，执导由钟汉良、刘恺威、吕一联合主演的情感剧《菩提树下》。

2012年，执导的武侠剧《天涯明月刀》在湖南卫视首播；11月10日，执导的古装武侠剧《咏春传奇》在福建电视台综合频道首播，该剧由周扬、张丹峰、郑佩佩等联袂主演；同年，执导由苏有朋、秦岚、傅艺伟联合主演的都市爱情剧《非缘勿扰》。

2013年，执导的武侠剧《天龙八部》播出，该剧由钟汉良、金起范、张檬等联袂主演，并在剧中饰演丐帮第八代帮主汪剑通；同年，执导由韩栋、赵圆瑗合作主演的动作电影《太极·道》。

2014年，执导由韩栋、张檬、魏千翔等联袂主演的武侠剧《鹿鼎记》，并在剧中饰演清初权臣、“满洲第一勇士”鳌拜。

2015年，担任大型电视纪录片《万家姓》总导演，同年参加第二届中国河源微电影节并为著名客家音乐人陈善宝颁奖。

2016年，执导由王龙华、张含韵、李宗翰、王刚等联袂主演的古装青春剧《重耳传》；同年，执导由严屹宽、秦岚、谢贤等主演的年代剧《万水千山总是情》。

2017年，执导由何润东、张馨予等人主演的古装悬疑剧《花谢花飞花满天》；同年，执导由鞠婧祎、炎亚纶、王艳等联袂主演的民国悬疑剧《请赐我一双翅膀》，2018年1月剧组杀青。

2022年1月，赖水清担任青春校园剧《同学们恰恰恰》出品人。

2022年3月，由赖水清担任出品人、监制及总导演的古装网剧《我家侯爷不宠我之欢喜冤家》上海开机 。

赖水清除了有“老戏新拍”的本事，还有慧眼识珠的技能。他在选演员时始终有一个原则：养眼（网易新闻评）。

他身上有种平实不失惊艳的特征，赖水清和他的翻拍剧像武当派，吸纳百家、融会贯通、既不具侵犯性，也牢不可破。在尊重原著的基础上，感情线和人物性格稍作创新，在造型上勇于创新，甚至在演员的选择上也非常大胆有突破。在选角上，《天龙八部》充分体现了赖水清的创新和大胆，他眼光是犀利的（金鹰网评）。