费迪南多是托斯卡纳大公莱奥波尔多一世（即后来的神圣罗马皇帝利奥波德二世）的次子。1790年，伯父神圣罗马帝国皇帝约瑟夫二世逝世，父亲将托斯卡纳大公国交给费迪南多后返回奥地利继承皇位。

刚即位的费迪南多马上面临法国大革命的威胁。1792年，费迪南多承认了法国新建立的共和政府。随着第一次反法同盟的形成，英俄两国试图拉拢费迪南多，但看到法军一连串胜利的费迪南多于1795年宣布托斯卡纳维持中立。好景不长，随着共和派于1799年在佛罗伦萨建立新的政府，费迪南多被迫流亡至维也纳。

1801年，伊特鲁里亚王国建立，由波旁王朝的帕尔马支系统治。1807年，拿破仑将伊特鲁里亚王国并入法国，两年后拿破仑重建托斯卡纳，并把妹妹埃莉萨·波拿巴封为女大公。随着拿破仑于1813年10月的莱比锡战役战败、1814年巴黎向第六次反法同盟投降，费迪南多回到托斯卡纳，重新成为大公。1824年，费迪南多逝世，由儿子莱奥波尔多二世继位。