玛丽亚·阿玛莉亚的父母是那不勒斯和西西里国王费迪南多一世和奥地利的玛丽亚·卡罗利娜女大公。她的姐姐玛丽亚·特蕾莎是神圣罗马帝国皇后。

年幼的她曾经和法国王太子和表哥路易·约瑟夫订婚，但七岁的路易·约瑟夫在1789年病逝。1793年，她的姨母玛丽·安托瓦内特一家在法国大革命期间被害。

1809年，玛丽亚·阿玛莉亚和法国奥尔良王朝的路易·菲利普结婚。这段婚姻引起不少的争论，因为路易·菲利普的父亲路易·菲利普二世在革命期间支持处决表亲路易十六和其妻玛丽·安托瓦内特。玛丽亚·阿玛莉亚的母亲兼玛丽·安托瓦内特的姐姐玛丽亚·卡罗利娜，起初也因为相同原因而不太喜欢这婚姻。

1848年，法国爆发革命并推翻了路易·菲利普。她一家自此流亡到英格兰并得到维多利亚女王的款待。