2000年3月，总统巴斯德·比齐蒙古辞职后他任卢旺达临时总统；4月17日，当选总统；4月22日，宣誓就职。

2003年8月，在卢旺达举行的首次多党选举中获胜后当选总统。

2010年8月9日，以93.08%的选票成功连任卢旺达总统。

2017年8月4日，以98.79%的得票率成功连任卢旺达总统，任期至2024年。

当地时间2024年7月15日，卢旺达举行总统选举投票，保罗·卡加梅为总统候选人。

当地时间2024年7月15日，根据卢旺达国家选举委员会公布的初步结果，卢旺达现任总统、卢旺达爱国阵线总统候选人保罗·卡加梅以99.15%的得票率领先。

当地时间2024年7月18日，卢旺达选举委员会初步计票结果显示，卡加梅以99.18%的得票率获胜。

2024年7月22日，卢旺达国家选举委员会公布总统选举最终结果，现任总统卡加梅赢得连任。

当地时间2024年8月11日15时，成功连任的卢旺达总统保罗·卡加梅在首都基加利的国家和平体育场宣誓就职。

2003年正式当选总统后，以卡加梅为核心的“爱阵”以绝对优势掌控着中央政府、议会和地方政府，反对党在卢旺达注册和生存十分困难，只能通过与“爱阵”合作换取生存空间。卡加梅特别注重维护“爱阵”一党独大地位，采取有利措施管控、分化、打压反对党，对反对者毫不留情，据称有不少反对者遭到秘密逮捕和处决。

卡加梅在2016年任期届满，按宪法规定无法继续连任。但国内370万民众签名上书，请愿修宪，要求卡加梅继续留任。2015年12月，卢旺达完成全民公投，98%的民众投票支持更改总统任期，为卡加梅连任扫清了障碍。

卡加梅要求宣传部门将“腐败乃发展之敌”“腐败者毁国”等反腐标语遍贴街头。他要求全国逾4000名公职人员每年必须申报财产，授权监察官员负责调查其中可疑的资产增额。卡加梅坚决严惩侵占公共财产或以权谋私的官员，即使是内阁部长和革命老战友一旦涉案也绝不姑息，腐败官员不存在降职使用或“带病”上岗一说，一经惩处决不再用。他以身作则，每年带头申报财产，第一家庭的资产总额和增额都清晰公示。此外，卡加梅的亲属无一在政府任职，无一参与大公司运营。在国际清廉指数排名中，卢旺达位列非洲第八，是非洲最清廉的国家之一。

1994年的卢旺达种族大屠杀致使卢旺达社会解体，卡加梅上台后力主废除胡图、图西等民族分野，构建统一国民身份认同。他注重消解民族仇恨，本着“重和解、轻处罚”的原则，在全国启用了近万个传统的“盖卡卡法庭”，由全体村民参与审判大屠杀罪犯，为促部族和解和社会公平发挥了巨大作用。在卡加梅治理下，卢旺达族群紧张关系得到缓解，除流亡国外的反对派外，国内民族和解基本达成，族群间的争斗基本销声匿迹。

卢旺达种族大屠杀给卢旺达经济、社会带来灾难性后果，经济崩溃、基础设施损毁、大量人口陷入赤贫，国家千疮百孔。卡加梅上台后迅速着手国家重建和经济恢复，通过推行市场经济、私有化、贸易自由化、大力吸引外资等系列措施推动经济发展。针对卢旺达位于封闭内陆，地少人多，经济基础薄弱的特点，卡加梅推出了《2020年愿景规划》，重点建设良政和高效政府，推动人力资源开发和知识型经济建设，发展私营经济、基础设施建设和高产高效农业。在其治下，卢旺达成为非洲发展速度最快的国家之一，经济年均增速始终保持8%以上，人均GDP翻番，数十万人脱贫，卫生教育状况也得到显著改善。

卡加梅2016年被推选为非盟改革特别委员会主任，2018年又任非盟轮值主席，承担非盟改革重任。他强调非洲要“以同一个声音说话”，誓言要“引领非洲走向复兴”，强调优先聚焦非洲事务、非盟机构改革、扩大与民众联系、提高行政效率、持续自主融资等五大领域的改革。在卡加梅领导下，非盟推出了成员国自主缴纳会费、签署单一航空运输市场协议和非洲大陆自贸区协定等重大改革举措。

卢旺达与西方国家关于民主、自由、人权等问题的争论一直存在。卡加梅寻求长期连任后，西方国家对他谋求“第三任期”问题进行口诛笔伐，指责其“不民主”、“反人权”。卡加梅反对把西方国家的价值观强加诸卢旺达，加诸非洲，强调第三世界国家的发展“需要有组织民众的威权”。

2021年5月27日，法国总统埃马纽埃尔·马克龙抵达卢旺达首都基加利，开始对卢旺达为期两天的国事访问。卡加梅同马克龙在基加利举行了会晤，期间马克龙承认法国对1994年发生的卢旺达大屠杀负有责任。之后卡加梅在联合新闻发布会上说，马克龙的演讲坦承事实，“重要”且对两国关系具有“特殊意义”。两国关系将“大幅改善”，从而在经济、政治和文化方面造福两国人民。卢旺达希望同法国在双方共同关心的重要问题上建立牢固和可持续的关系。

卡加梅一直对中国抱有友好感情。卢旺达重建初期，台湾当局曾以金钱拉拢，但卡加梅不为所动。卡加梅赞赏中非传统友谊及合作成果，认为卢中关系是“远超利益范畴的特殊关系”。在2017年“爱阵”特别大会、2018年“爱阵”全国代表大会及卡加梅总统就职仪式上，中国均是唯一获邀的域外国家。

卡加梅多次在有西方国家领导人出席的活动中批驳恶意攻击非中关系的不实论调，称自己“在很多时候充当了中国在非洲的大使角色”。针对西方国家攻击中国在非推行“新殖民主义”的言论，他在英国《卫报》上发表题为“为什么非洲欢迎中国人”一文，称赞中非务实合作是互利双赢的，西方国家才应反思自身在非洲的所作所为。

2018年9月，来华参加中非合作论坛北京峰会的卢旺达总统卡加梅在北京接受中国媒体联合采访时表示，当前全球化进程面临挑战，迫切需要加强国际合作，中非合作论坛北京峰会的举办正当其时，非常重要。

2021年11月12日，中国国家主席习近平同卢旺达总统卡加梅互致贺电，庆祝两国建交50周年。

2024年7月23日，中国国家主席习近平致电保罗·卡加梅，祝贺他当选连任卢旺达共和国总统。

当地时间2024年8月11日，卢旺达总统卡加梅就职典礼在首都基加利举行。中共中央对外联络部部长刘建超应邀率中共代表团出席。

2024年9月3日，中共中央政治局常委、国务院副总理丁薛祥在北京会见来华出席中非合作论坛北京峰会的卢旺达总统卡加梅。9月5日晚，国家主席习近平在北京人民大会堂会见来华出席中非合作论坛北京峰会的卢旺达总统卡加梅。

卡加梅出身图西贵族，其母奥斯 特里亚是王后的表亲。

1989年，卡加梅与珍妮特·尼拉芒吉结婚。

卡加梅2009年即注册推特账户，是最早注册推特的国家领导人之一，拥有120余万粉丝。他几乎每天推文，并积极回复粉丝的留言。推文内容涵盖政治事务、国际问题、民众生日，甚至游戏攻略等各个方面。

此外，卡加梅还是网络相簿、脸书的资深用户，拥有数十万粉丝。

在促进卢旺达经济发展的方面，卡加梅比任何一个非洲国家的领导人都要走得更远，他消除了腐败，让首都基加利成为非洲最安全的城市之一。（美国佛罗里达大学教授勒内·勒马尔尚评）

保罗·卡加梅在带领卢旺达走出种族屠杀后的废墟、重建经济的过程中，探索出了一条符合本国国情的政策路线，通过采取有效政策措施及其个人的强势领导，卢旺达发展取得了显著成就。战争与大屠杀的阴影渐渐退去，卢旺达成为非洲国家发展的模范与标杆，卡加梅本人在国内外也赢得了很高声誉，成为很多非洲国家领袖敬佩和学习的对象。（中国现代国际关系研究院殷悦评）