2016年12月16日，上海地铁第4000辆列车暨上海地铁9号线三期首列0954号车抵达上海。

2017年12月30日，上海地铁9号线三期东延伸段（杨高中路站【不含】至曹路站）开通运营。

2020年1月25日至1月29日，上海地铁9号线松江南站站至松江新城站上行（往松江新城方向）单向隧道临时停运整修施工，下行隧道采用单线双向方式运营。

2024年6月22日（本周六）起，上海地铁3、4、9号线宜山路站新地下换乘通道将正式启用。新通道平均宽度约10米，加上新增的自动扶梯、空调系统等配套服务设施，乘客换乘时将更为舒适便捷。

2024年9月21日起，2024年版上海轨道交通网络示意图将逐步在全网车站、车厢内更新，9号线松江南站站更名为“上海松江站”站。“出站换乘”的图例也做了调整。

据上海地铁官网数据显示，上海地铁9号线共设有35座车站，其中31座地下站、4座高架站（以上信息截至2024年5月）。上海地铁9号线岛式车站（除曹路站）均开启左侧车门，侧式车站均开启右侧车门，地下一岛一侧式车站（中春路站、桂林路站）：往曹路方向均开启左侧门、往松江南站方向均开启右侧门，曹路站：往松江南站方向开启左侧门、往曹路方向开启右侧门。

各站站层布置图如下图所示。（最新信息请以上海地铁官网站层图为准）

上海地铁9号线呈东北—西南走向，线路西南起自松江区松江南站站，途经闵行区、徐汇区、黄浦区，东北止于浦东新区曹路站，联通了松江新城、徐家汇副中心、陆家嘴金融贸易区、世纪大道枢纽、金桥出口加工区、曹路镇大型居住社区等多个重要区域和客流集散点。

据上海地铁官网数据显示，上海地铁9号线首末班车时刻表如下所示（以上信息截至2024年5月）：自2024年4月30日起，上海地铁9号线逢周末（周五、周六，逢法定节假日另行安排）实施延时运营的末班车始发时间均调整至次日0点。

据上海地铁官网信息显示，上海地铁9号线列车运行间隔如下表所示（以上信息截至2024年5月）：

2010年3月，上海地铁9号线日均客流突破25万人次。

2018年3月9日，上海地铁9号线单日客流量达115万人次。

2019年3月8日，上海地铁9号线单日客流量达128.8万人次。

2019年1月至6月，上海地铁9号线日均客流98.5万人次，同比增长7.5%。

上海地铁9号线列车中，09A01、09A02型车内不设LCD电子线路指示图，车厢连接处设有显示屏。09A03、09A04型车内设有LCD电子线路指示图，除了车厢连接处有LED显示屏外，每节车厢内加设两组背靠背LED显示屏，车身设有目的地显示屏。

上海地铁9号线具体的引车组构造如下所示：

上海地铁9号线拥有九亭基地和金桥基地。

九亭基地：位于上海市沪松公路中春路北侧，在中春路站设出入库线，用于上海地铁9号线列车停放与养护。

金桥基地：位于金海路南侧，金穗路东侧，在金吉路站设出入库线，与上海地铁12号线和上海地铁14号线共用，用于上海地铁9号线列车的停放和养护。

上海地铁9号线徐家汇站建设工程涉及大面积的地下室结构改建、大断面暗挖加层施工、紧贴刚建成不久的港汇超高层建筑先后施工等问题。为了从根本上解决换乘大厅施工对地面交通和地区商业的不利影响，首次在中国国内采用了地下室向下盖挖加层技术，由于地处徐家汇商圈并紧邻上海地铁1号线徐家汇站，原地下一层的净空只有4.1米，各种工序所需的施工机械均须满足低净空的要求，整个2000平米的地下空间只有顶板上5.1米×5.8米的出土孔作为土方、材料垂直运输通道，施工效率低，而且地下空间内的通风及照明都受到限制，施工条件恶劣，且环境保护要求高、施工区域管线众多、地形复杂。

在商城路站至小南门站上、下行线盾构区间，上海地铁9号线盾构机沿中华路推进时需穿越使用中的复兴东路隧道浦西引导段及其地下连续墙。为确保盾构能够穿越4处地下墙，同时确保工程的施工进度，建设方在中国国内首次采取了对地下墙采取地下深层爆破进行预先处理，然后盾构再进行穿越的方法。

上海地铁9号线的宜山路站设计为地下四层岛式结构，从上海地铁4号线地下车站的下方实施穿越交叉，是同期建设的地铁车站中最深的一座车站；该区域地质水文条件极为复杂，土质暗含流沙，施工难度大、风险极高；穿越上海地铁4号线过程中遇到了混凝土围护墙，这给盾构推进带来了极大挑战。

上海地铁9号线九亭站公交枢纽项目位于沪松公路以北、沪亭北路以西，用地面积为5517平方米。该项目于2021年3月正式开工，计划2022年12月竣工。九亭站公交枢纽属于立体式多层开发，项目设置了两层配套用房，首层架空结合场地作为公交首末站，可同时容纳6条以上公交线路。地下车位达300个，与轨交形成便捷的换乘系统。

2023年10月，上海轨交9号线佘山站公交枢纽工程通过竣工验收。

上海地铁9号线一期工程站台装修以“古道时速”为主题。书法站名、大型壁画等多种元素共同诠释了松江区的历史和现实，体现松江区的地域文化特点和交通功能。

上海地铁9号线二期车站装修在一期基础上力求简洁实用，采用统一风格不同色的设计，每个车站大字壁背景以不同颜色区分，在徐家汇、马当路等车站还装饰有以该地区为特色的壁画。

上海地铁9号线三期东延伸段车站设计秉承“开放自由还原本质”的理念，上顶面采取大面积的裸露，精简装饰，还原建筑形体本质的特色；车辆管理用房采用人性化设计，营造简洁明快、现代的办公环境，避免了地下办公空间的沉闷感。

上海地铁9号线是上海轨道交通网络中重要的市域级骨干线路，一期工程开辟了松江新城与上海市中心区之间的一条快速通道，缩短了松江新城与上海市中心的时空距离。（东方网 评）

上海地铁9号线三期南延伸段串联起了松江老城区，紧邻醉白池、上海方塔园、松江清真寺等多个名胜古迹，缓解了松江老城区交通问题，方便了市民游览；其使对接的沪昆高速铁路沿线车站松江南站，成为上海西南一个新的交通枢纽。（《新闻晨报》评）

上海地铁9号线为新线路更深的挖造奠定了基础，积累了宝贵经验。（上海申通地铁集团有限公司 评）